Oddělení umění středověku se zabývá výzkumem architektury a vizuální kultury na území českých zemí v evropských souvislostech, od doby christianizace po polovinu 16. století. V rámci institucionální badatelské priority Proměny funkcí výtvarného díla se pracovníci oddělení podíleli na přípravě rozsáhlé dvoudílné monografie věnované proměně funkcí středověkého díla, která završila práci na grantu GAČR Imago, Imagines. Na tento projekt, sledující výtvarné dílo mezi objednavatelem, tvůrcem a recipientem navázaly další aktuálně řešené granty GAČR zaměřené na výzkum umění v českých zemích v době vlády Přemyslovců, výzkum středověkých modlitebních knih a specificky zacílený grant sledující téma Jeruzaléma v českém středověkém umění. Ten byl v roce 2024 završen vydáním kolektivní monografie Reflecting Jerusalem in Medieval Czech Lands (Lenka Panušková, Jan Dienstbier, Kateřina Kubínová, Milada Studničková).V rámci Strategie AV21 (Anatomie evropské společnosti) je rozvíjen výzkum umění zaměřený na ženy jako donátorky a mecenášky umění, v letech 2022 a 2023 byly uspořádány mezinárodní konference na toto téma. Řada pracovníků oddělení se v posledních letech podílela i na řešení interdisciplinárního projektu NAKI II Gotické a raně renesanční umění ve východních Čechách, který byl v roce 2020 završen výstavou spolu s trojdílným vědeckým katalogem. Významný byl také podíl oddělení na celoústavním projektu výstavy a doprovodné odborné monografie „… a viděl jsem nové nebe a novou zemi…“ Apokalypsa a umění v českých zemích.
K dalším významným recentním publikacím, vzniklým za přispění pracovníků oddělení, patří knihy o středoevropském knižním malířství pozdní gotiky Art in an Unsettled Time. Bohemian Book illumination before Gutenberg (Milada Studničková, 2018), The Velislav Bible: Finest Picture-Bible of the Late Middle Ages (Lenka Panušková, 2018) či Pražský evangeliář Cim 2. Rukopis mezi zeměmi a staletími středověké Evropy (Kateřina Kubínová, 2017). V roce 2020 se pracovníci oddělení podíleli na vydání knihy Ivo Kořán / Texty (Klára Benešovská, Helena Dáňová, David Vrána) a na dvoudílné publikaci Více Krásy + Skok vysoký Josefa Krásy (Klára Benešovská, Jan Chlíbec, Tereza Johanidesová).
Oddělení umění středověku systematicky rozvíjí spolupráci s Centrem raně středověkých studií: Západ, Byzanc, Islám (FF MU Brno), a to zejména na editorské bázi při přípravě jednotlivých čísel prestižní mezinárodní revue Convivium či při vydávání drobnějších prací v rámci edice Parva Convivia (Jan Klípa). Pracovníci oddělení dále spolupracují s řadou předních oborových pracovišť (Filozofické fakulty Univezity Karlovy v Praze, Masarykovy univerzity v Brně a Palackého univerzity v Olomouci) a oddělení poskytuje zázemí pro doktorandské projekty (Barbora Uchytilová). Zároveň oddělení kooperuje s dalšími odbornými pracovišti (např. Národní galerie v Praze, Národní památkový ústav, Österreichische Akademie der Wissenschaften), jsou zapojeni do řešení dílčích projektů v rámci Strategie AV21, podílí se na práci vybraných odborných grémií a jsou členy redakčních rad řady oborových časopisů.